Hipotiroidisme dapat mempengaruhi kehamilan wanita dalam tiga cara: Pertama, hipotiroidisme mempengaruhi aksis gonad wanita, yang mengakibatkan ovulasi atau anovulasi sporadis, menstruasi yang tertunda, aliran menstruasi yang rendah dan bahkan amenorea. Ovulasi yang tidak teratur, endometrium yang tipis, dan aliran menstruasi yang rendah dapat memengaruhi penyatuan sperma dan sel telur serta pembuahan sel telur, sehingga memengaruhi kehamilan wanita. Kedua, hipotiroidisme dapat menyebabkan perkembangan embrio tertunda atau bahkan berhentinya perkembangan embrio pada tahap awal kehamilan, sehingga dapat mempengaruhi kehamilan pasien. Ketiga, hipotiroidisme dapat memengaruhi perkembangan mental dan perkembangan fisik janin, dan akhirnya menyebabkan janin menjadi kretin.