Pembedahan harus direkomendasikan untuk UC yang tidak merespons terhadap terapi obat intensif. Keputusan untuk mengoperasi paling baik dibuat oleh ahli gastroenterologi dan ahli bedah kolorektal bersama dengan pasien. Kondisi lain seperti hiperplasia heterogen atau karsinoma, penyakit yang tidak terkontrol dengan baik, eksaserbasi akut UC kronis, atau eksaserbasi akut UC kolon residual setelah kolektomi harus didiskusikan dalam hal pilihan perawatan bedah.
Pasien dengan CD harus dioperasi hanya pada pasien yang bergejala daripada yang asimtomatik, dan pencitraan pra-operasi harus dilakukan karena potensi penetrasi, yang biasanya kambuh setelah operasi. Reseksi segmen usus harus konservatif. Ada beberapa uji klinis terkontrol secara acak mengenai pilihan pembedahan dan prosedur pembedahan untuk IBD.
Prinsip-prinsip umumnya adalah sebagai berikut: 1. Pasien dengan IBD yang memerlukan pembedahan sebaiknya dirawat di bawah perawatan bersama seorang ahli bedah dan gastroenterologi yang memiliki minat pada IBDD (Level C).
Konsultasi pra-operasi dan penandaan lokasi fistula harus dilakukan oleh spesialis perawatan kolorektal klinis yang memiliki keahlian dalam perawatan fistula (Level C).