Ada dua jenis pengobatan utama untuk enterokolitis hemoragik, pengobatan non-bedah, yang meliputi pengobatan umum dengan istirahat dan puasa. Istirahat total dan puasa harus diberikan selama periode nyeri perut, darah dalam tinja dan demam sampai muntah berhenti, darah dalam tinja berkurang dan nyeri perut berkurang sebelum diet cair diberikan, yang secara bertahap ditingkatkan kemudian. Cairan yang sangat bergizi tinggi, seperti glukosa 10%, asam amino majemuk, dan protein terhidrolisis, harus ditambahkan secara intravena selama periode puasa. Konsumsi makanan yang terlalu dini dapat menyebabkan penyakit kambuh, tetapi terlalu terlambat memulai kembali makanan dapat mempengaruhi status gizi dan menunda pemulihan. Dekompresi gastrointestinal dapat dilakukan untuk distensi abdomen dan muntah yang parah, dan obat antispasmodik dapat diberikan untuk nyeri abdomen. Selain itu, perhatian harus diberikan pada koreksi gangguan elektrolit air. Kehilangan air, kehilangan natrium dan kehilangan kalium lebih sering terjadi pada penyakit ini, dan infus total dan komponen dapat diberikan sesuai dengan kondisi. Selain itu, penting untuk menahan syok dan dengan cepat mengisi kembali volume darah yang efektif. Selain melengkapi larutan kristaloid, koloid yang sesuai seperti plasma, darah utuh segar dan albumin serum manusia harus ditransfusikan, dan mereka yang tekanan darahnya tidak naik dapat diobati dengan obat vasoaktif. Selain itu, perlu untuk menggabungkan antibiotik untuk mengendalikan infeksi pada saluran usus, yang dapat mengurangi gejala klinis. Antibiotik yang biasa digunakan adalah aminobenzil penisilin, kloramfenikol, gentamisin dan kanamisin. Selain itu, hormon adrenokortikotropik harus diterapkan, yang dapat mengurangi gejala toksik dan menekan reaksi alergi, dan juga membantu dalam memperbaiki syok, tetapi ada risiko memperburuk perdarahan usus dan memicu perforasi usus. Terakhir, pengobatan simtomatik terhadap rasa sakit. Mereka yang mengalami demam tinggi dan mudah tersinggung dapat diberikan oksigen, antipiretik, obat penenang, dan pendinginan fisik. Jika perawatan medis tidak efektif, perawatan bedah bisa menjadi pilihan.