Kista prostat terutama disebabkan oleh kelainan perkembangan janin bawaan serta faktor penyakit yang didapat. Kista prostat dapat menjadi sekunder akibat penyakit seperti prostatitis dan uretritis posterior, dan juga dapat disebabkan oleh operasi seperti kateter menetap jangka panjang, operasi prostat, dan terapi panas prostat. Pasien dengan kista kecil tanpa gejala tidak memerlukan pengobatan dan harus terus dipantau atau ditinjau secara teratur. Pasien dengan kista yang lebih besar dan bergejala memerlukan pengobatan yang tepat, yang mungkin termasuk suntikan tusukan agen sklerosis dan operasi pengangkatan.