Durasi penggunaan antibiotik terkait dengan kondisi spesifik pasien. Pasien dengan lesi infeksi akut sebaiknya tidak menggunakan antibiotik terlalu lama untuk menghindari efek samping, sementara kondisi kronis dapat diperpanjang dengan tepat. Tidak ada batasan mutlak untuk durasi penggunaan antibiotik dan itu tergantung pada jenis infeksi, tingkat keparahan kondisi pasien dan apakah pasien telah mengembangkan resistensi obat atau disbiosis. Secara umum, untuk infeksi bakteri akut yang umum, durasi antibiotik tidak boleh lebih dari 7 hari, tetapi pengobatan spesifik harus dianalisis sesuai dengan kondisi spesifik. Misalnya, pasien dengan faringitis bakteri akut dan tonsilitis perlu menggunakannya selama 10 hari, pasien dengan prostatitis bakteri akut perlu menggunakannya selama 4 minggu, sedangkan prostatitis bakteri kronis perlu digunakan selama 1-3 bulan. Namun, jika terjadi resistensi obat atau disbiosis, pengobatan antibiotik harus dihentikan atau diubah. Penggunaan antibiotik harus di bawah bimbingan dokter dan penyalahgunaan antibiotik harus dihindari.