Manifestasi khas herpes genital adalah kelompok lepuh kecil yang dengan cepat pecah untuk membentuk vesikel atau ulkus superfisial, biasanya di labia, kulup dan daerah perianal, dengan gejala spontan yang lebih ringan daripada yang awal, berlangsung 6-10 hari sebelum penyembuhan; manifestasi atipikal adalah eritema terbatas non-spesifik, vesikel belang-belang, fisura, bisul, mengalir, nodul keras, bisul dan folikulitis, yang dapat dilihat di mons pubis, labia, perineum dan bokong. Mereka tidak mudah dikenali oleh pasien dan dokter, sehingga mengakibatkan kasus yang terlewatkan dan salah didiagnosis, membuat kelompok ini tidak diobati dan secara tidak sengaja menjadi sumber infeksi.