Usus besar juga dikenal sebagai usus besar, dan bagian dekat anus disebut rektum, yang bergabung dengan kolon sigmoid, kolon desendens, kolon transversal dan sekum dalam urutan itu. Sekum terhubung ke ileum terminal (bagian dari usus kecil) melalui lubang ileocecal, yang juga dikenal secara kolektif sebagai bagian ileocecal. Dinding saluran pencernaan seperti dinding rumah dan memiliki beberapa lapisan: lapisan mukosa di dekat rongga usus seperti lapisan plesteran dinding, lapisan submukosa adalah celah di bawah lapisan plesteran, dan di bawahnya adalah lamina propria, yang merupakan struktur pendukung saluran pencernaan dan mirip dengan lapisan batu bata dinding. Mudah untuk memahami penyakit radang usus dengan memahami struktur-struktur ini: borok adalah lapisan plesteran dinding yang rusak. Karena peradangan difus kronis pada lapisan mukosa, mukosa normal tidak terlihat pada lapisan plesteran dinding usus yang sakit, yang sebagian besar merupakan lesi yang terus menerus, dan lapisan otot intrinsik dinding usus tidak terlibat secara signifikan, sehingga borok biasanya tidak cukup dalam untuk menyebabkan perforasi, fistula atau penyempitan atau obstruksi. Ulserasi seperti penghancuran lapisan plesteran dinding, dan karena lesi menjadi lebih parah semakin dekat ke anus, eksudasi nekrotik lapisan mukosa dimanifestasikan oleh diare, tinja berdarah atau munculnya lendir seperti ingus dalam tinja. Dalam kasus penyakit Crohn, seluruh dinding usus terpengaruh, yang berarti bahwa seluruh dinding rusak, sehingga bisulnya dalam dan dapat dengan mudah menembus dinding usus yang menyebabkan perforasi, fistula, penebalan seluruh dinding usus atau pembentukan bekas luka yang dapat dengan mudah menyebabkan penyempitan atau obstruksi.