Pemeriksaan CT otak pada orang dengan gangguan kejiwaan dapat digunakan untuk mendiagnosis atau mengesampingkan adanya lesi organik di otak, tetapi mungkin penggunaannya terbatas dalam diagnosis gangguan kejiwaan. Hal ini karena beberapa gangguan kejiwaan tidak memiliki perubahan struktural yang jelas di otak. Dalam hal ini, terserah dokter untuk membuat penilaian dalam hubungannya dengan kriteria diagnostik untuk setiap gangguan kejiwaan, dan CT umumnya hanya berguna sebagai bantuan untuk diagnosis.