Berapa lama waktu yang dibutuhkan pasien untuk pulih dari infeksi intrakranial tidak dapat digeneralisasi dan tergantung pada tingkat keparahan kondisi pasien serta apakah mereka menerima pengobatan yang tepat waktu dan efektif. Faktanya, ada banyak patogen berbeda yang dapat menyebabkan infeksi intrakranial, termasuk virus, bakteri, jamur, spirochetes, parasit, dan rickettsiae. Tingkat keparahan infeksi intrakranial bervariasi dari satu penyebab ke penyebab lainnya dan prinsip pengobatannya pun sedikit berbeda, sehingga prognosis dan waktu pemulihannya pun berbeda-beda. Secara umum, pasien dengan infeksi intrakranial ringan dapat pulih dalam 2-3 minggu, sementara beberapa pasien dengan infeksi intrakranial berat mungkin memerlukan waktu beberapa bulan atau bahkan lebih lama untuk pulih, dan beberapa pasien mungkin akan mengalami kelumpuhan, penurunan kecerdasan dan gejala sisa lainnya setelah perawatan, yang dapat memengaruhi kualitas hidup dan kelangsungan hidup hingga batas tertentu. Dianjurkan untuk segera mencari bantuan medis setelah terjadinya infeksi intrakranial, dan meningkatkan pemeriksaan yang relevan untuk mengklarifikasi penyebab spesifik penyakit dan kemudian mengobatinya secara aktif. Jika pasien mengalami abses otak septik, kebutuhan akan kraniotomi harus dinilai jika diperlukan jika pengobatan konservatif tidak efektif.