Klomifen dan gonadotropin menginduksi ovulasi dan kehamilan pada sebagian besar wanita yang tidak subur; namun, ada kekhawatiran tentang efek buruk dari stimulan ovulasi ini terhadap kehamilan, terutama dalam hal teratogenisitas pada embrio yang sedang berkembang. Malformasi kongenital adalah cacat struktural yang terlihat pada saat lahir, meskipun banyak kelainan pada tingkat seluler dan molekuler, yang pada dasarnya juga merupakan bawaan lahir, tidak termasuk dalam statistik umum. Insiden malformasi kongenital pada populasi normal setelah usia kehamilan 28 minggu berkisar antara 3,1%0 hingga 22,5%.0 Sebuah survei di seluruh dunia baru-baru ini menunjukkan bahwa insiden malformasi kongenital pada sekitar 20 juta kelahiran adalah 8,3%0 berdasarkan akta kelahiran, 1,26% berdasarkan catatan rumah sakit, 4,5% berdasarkan pemeriksaan dokter anak, dan meningkat dua kali lipat menjadi 7,5% berdasarkan pemeriksaan bayi pada usia 6 bulan dan 12 bulan. 7,5 persen. Karena batas antara morfologi normal dan abnormal sering kali kabur, hal ini menyebabkan tingkat variabilitas yang tinggi dalam kejadian. Penginduksi ovulasi telah digunakan secara klinis selama hampir 50 tahun, dan banyak kehamilan yang terjadi selama atau setelah pengobatan, sehingga penting untuk mengetahui apakah penginduksi ovulasi dapat meningkatkan risiko seorang wanita untuk melahirkan seorang anak dengan kelainan bawaan. Dari penelitian yang dilakukan selama bertahun-tahun, jelas bahwa obat pemicu ovulasi tidak meningkatkan risiko terjadinya kelainan. Ada beberapa temuan yang menunjukkan bahwa obat penginduksi ovulasi dapat dikaitkan dengan malformasi kongenital. Namun, ada anggapan bahwa anovulasi dengan penuaan sel telur sering terjadi pada kehamilan kembar, kesuburan yang rendah, dan dengan obat-obatan seperti clomiphene, dan bahwa terjadinya malformasi lebih mungkin terkait dengan kesuburan yang rendah daripada karena obat-obatan itu sendiri. Ada kemungkinan bahwa sel telur dapat rusak sebelum implantasi dalam rongga rahim, atau bahkan sebelum pembuahan, atau bahwa malformasi mungkin disebabkan oleh penuaan sel telur atau sperma itu sendiri.