Transplantasi sel punca hematopoietik autologus tidak direkomendasikan secara rutin karena tingkat kelangsungan hidup secara keseluruhan tidak lebih baik daripada kemoimunoterapi. Transplantasi sel punca hematopoietik alogenik adalah satu-satunya obat untuk gonorea lambat, tetapi karena gonorea lambat terutama terjadi pada pasien usia lanjut, hanya sejumlah kecil pasien muda berisiko tinggi dengan donor yang cocok dengan HLA yang cocok untuk transplantasi. Indikasi yang disarankan: 1. Resistensi fluorarabin: tidak ada respons terhadap terapi berbasis analog purin atau kambuh dalam waktu 12 bulan setelah pengobatan; 2. Pasien dengan kelainan gen p53; 3. Pasien dengan del (1lq) yang tidak dapat mencapai remisi total dengan pengobatan; 4. Pasien dengan sindrom Richter.