Transplantasi sel punca hematopoietik diindikasikan untuk pengobatan anemia aplastik berat, leukemia dan penyakit hematologi lainnya. Harapan hidup setelah transplantasi bervariasi dari satu orang ke orang lain. Pengobatan HSCT yang berhasil dapat menyebabkan kelangsungan hidup jangka panjang, sementara beberapa pasien dapat kambuh tiga tahun setelah transplantasi, dengan prognosis yang lebih buruk dan masa bertahan hidup yang lebih pendek. Transplantasi sel punca hematopoietik cocok untuk pengobatan anemia aplastik berat, leukemia, mieloma, limfoma, dan gangguan hematologi lainnya, dan merupakan pengobatan yang paling efektif untuk gangguan hematologi di atas saat ini. Tingkat kelangsungan hidup setelah HSCT juga terkait dengan reaksi penolakan, dan pasien dengan reaksi penolakan yang parah dapat memperburuk kondisinya, sehingga menyebabkan kegagalan transplantasi. Setelah HSCT berhasil, pasien dapat bertahan hidup untuk waktu yang lama dan melanjutkan pekerjaan dan kehidupan normal. Namun, beberapa pasien mungkin kambuh setelah transplantasi, sebagian besar dalam waktu 3 tahun setelah transplantasi. Pasien yang kambuh akan sulit untuk diobati, dengan prognosis yang lebih buruk dan masa kelangsungan hidup yang lebih pendek. Transplantasi sel punca hematopoietik perlu dilakukan setelah pemeriksaan oleh dokter dan tidak semua pasien cocok untuk transplantasi sel punca hematopoietik.