Biaya transplantasi sel punca hematopoietik autologus adalah sekitar 100.000-200.000 yuan, tetapi tidak ada biaya yang seragam, yang dapat bervariasi karena kondisi pasien serta perbedaan geografis.
Jika kondisi pasien buruk, selain HSCT autologus, mungkin akan membutuhkan biaya lebih banyak untuk mempersiapkan perawatan sebelum melakukan operasi, jika kondisi pasien baik, biayanya juga mungkin lebih murah, dan harganya juga mungkin berbeda di banyak rumah sakit kota tingkat pertama, dibandingkan dengan banyak kota di tingkat prefektur.
HSCT autologus lebih murah daripada HSCT alogenik karena mengekstrak HSCT dari tubuh pasien sendiri, membekukannya dalam nitrogen cair, lalu dengan cepat menyadarkan HSCT beku dan mentransfusikannya kembali ke dalam tubuh pasien, yang merupakan teknik yang lebih sederhana dibandingkan dengan HSCT alogenik, sehingga harganya sedikit lebih rendah.
Harga spesifiknya direkomendasikan untuk ditanyakan kepada rumah sakit setempat, di bawah bimbingan dokter untuk meningkatkan pemeriksaan yang sesuai dengan perawatan standar.