Pemeriksaan ultrasonografi usus pernah dianggap tidak akurat, berdasarkan adanya gas dalam jumlah besar di dalam usus, yang merupakan salah satu hambatan utama pemeriksaan ultrasonografi. Namun demikian, pembuangan gas dengan cara pengisian usus telah mengatasi keterbatasan ini. Ultrasonografi usus telah diakui sebagai alat diagnostik yang efektif untuk banyak penyakit usus. Dengan persiapan usus yang memadai, ultrasonografi usus dapat memvisualisasikan ketebalan dinding usus, hirarki usus besar dan rektum, penyempitan atau dilatasi lumen usus, dan lesi ekstra-usus. Ultrasonografi transabdominal yang dikombinasikan dengan ultrasonografi dapat memainkan peran penting dalam penyakit seperti penyakit Crohn dan tuberkulosis usus, di mana penebalan segmental dinding usus adalah fitur pencitraan utama. Hal ini memungkinkan penyaringan lesi (sebagian besar di daerah ileocecal), evaluasi aktivitas inflamasi dan penilaian efek pengobatan dengan melihat ketebalan dinding usus dan suplai darah, dan adanya komplikasi seperti striktur usus, fistula usus dan abses abdomen. Prevalensi yang tinggi dari penyakit-penyakit ini adalah pada remaja dan kekambuhan penyakit ini memerlukan beberapa evaluasi pencitraan, dan ultrasound telah menjadi tes tambahan yang penting dengan kelebihannya yang bebas radiasi, ekonomis dan nyaman.