H. pylori sendiri tidak menyebabkan sakit perut, tetapi berbagai penyakit yang disebabkannya dapat menyebabkan sakit perut. H. pylori dapat bertahan hidup dalam lingkungan asam yang kuat dan merupakan satu-satunya bakteri yang dapat bertahan hidup di dalam lambung. H. pylori dapat menyebabkan kerusakan pada mukosa lambung, yang menyebabkan gastritis erosif, tukak lambung, tukak duodenum, dan bahkan dapat menyebabkan kanker lambung, dan lain-lain. Helicobacter pylori menyebabkan gastritis erosif, yang dapat menyebabkan ketidaknyamanan seperti nyeri dan kembung di perut bagian atas. Jika menyebabkan tukak lambung dan tukak duodenum, dapat menyebabkan nyeri perut bagian atas yang kronis, periodik, dan berirama. Ulkus lambung sebagian besar terasa nyeri setelah makan, dan ulkus duodenum sebagian besar terasa nyeri saat lapar, sehingga infeksi H. pylori pada tubuh dapat menyebabkan berbagai gangguan yang dapat menyebabkan nyeri perut. Jika H. pylori positif ditemukan pada pemeriksaan fisik, pengobatan anti-H. pylori standar harus diberikan.