Pembedahan epilepsi berfokus pada pengangkatan lesi intraserebral yang menyebabkan kejang, termasuk sklerosis hipokampus, tumor otak, malformasi serebrovaskular (hemangioma), lesi stroke lama, dan malformasi perkembangan otak. Jenis pembedahan yang paling umum dilakukan adalah lobektomi temporal, yang melibatkan pengangkatan sebagian jaringan otak lobus temporal yang abnormal dan digunakan untuk mengobati pasien dengan “sindrom epilepsi lobus temporal medial”. Selain pembedahan untuk epilepsi lobus temporal, jenis pembedahan paling umum berikutnya adalah pembedahan lobus frontal, parietal, dan oksipital. Untuk pembedahan epilepsi di daerah-daerah ini, dimungkinkan untuk menggunakan teknik EEG invasif yang ditanamkan secara intrakranial untuk lokalisasi yang tepat dari daerah asal epilepsi. Setelah mendapatkan data EEG intrakranial yang memuaskan, reseksi yang tepat dari fokus epilepsi akan dilakukan berdasarkan hasil pemantauan. Selain prosedur “eksisi” ini, ketika kondisinya parah dan seluruh belahan otak terlibat, prosedur untuk memutuskan serat antara belahan otak secara bilateral atau stimulasi saraf vagus dapat digunakan untuk meringankan kondisi tersebut.