Pertama, indikasi, yang sekarang lebih luas, dan satu-satunya kontraindikasi absolut adalah trombosis atrium kiri. Ablasi kateter dapat dipertimbangkan selama kontrol farmakologis sulit untuk mempertahankan irama sinus atau amiodaron adalah satu-satunya obat untuk mempertahankan irama sinus. Kedua, toleransi pasien sebelum dan sesudah operasi terhadap antikoagulasi harus dievaluasi, dan jika ada kontraindikasi terhadap antikoagulasi warfarin, ablasi kateter juga tidak diindikasikan. Pasien umumnya mentolerir berbaring telentang selama 3-6 jam, selama itu mereka tidak dapat menggerakkan tubuh mereka, yang sangat penting untuk ablasi yang dipandu oleh sistem pelabelan 3D seperti CARTO atau Ensite, karena jika tidak, gambar 3D atrium kiri akan berbeda secara signifikan dari keadaan sebenarnya, yang menyebabkan lintasan ablasi yang tidak tepat atau perpanjangan waktu prosedur. Selain itu, karena sebagian besar ablasi kateter fibrilasi atrium sekarang dilakukan dengan kateter yang mengandung garam dingin, di mana cairan yang masuk cukup besar, sebagian besar pasien dikateterisasi sebelum operasi.