Infeksi oportunistik AIDS yang paling umum adalah Pneumocystis carinii pneumonia. Manifestasi klinis pasien biasanya batuk dan sesak dada, beberapa di antaranya disertai demam. Sebagian besar pasien memiliki gejala batuk dan dahak yang tidak terlalu menonjol, tetapi gejala sesak dada akan semakin memburuk, dan CT paru-paru menunjukkan adanya perubahan interstitial pada kedua paru-paru. Pasien seperti ini memerlukan pengobatan segera karena risiko kegagalan pernapasan yang mengancam jiwa. Pengobatan yang paling penting untuk pneumonia Pneumocystis carinii adalah pengobatan bakteri patogen, dan obat pilihannya adalah SMZ. Tentu saja, dalam kasus yang parah, kombinasi echinocandin direkomendasikan. Jika gejala sesak dada lebih terasa, hormon juga dapat digunakan untuk manajemen simtomatik.