Pemeriksaan kedokteran nuklir dapat dianggap sebagai pemeriksaan yang sangat aman. Ada tiga faktor utama yang tidak aman yang menyebabkan berbagai pemeriksaan pencitraan. 1, adalah agen pencitraan, agen kontras, agen kontras dan obat lain dari komposisi kimiawi dari dampaknya, terutama reaksi alergi dan reaksi toksik; 2, adalah radiasi yang disebabkan oleh radioaktivitas; 3, adalah melakukan pemeriksaan proses operasi yang disebabkan oleh kerusakan dan rasa sakit bahkan bahaya. Teknologi pelacak nuklida sangat sensitif, dan komposisi kimiawi obat radioaktif yang digunakan sangat kecil sehingga hampir dapat diabaikan, sehingga tidak akan menimbulkan reaksi alergi dan toksik. Kedua, nuklida yang digunakan dalam diagnosis nuklir terutama memancarkan sinar gamma, yang dicirikan oleh kemampuan penetrasi yang kuat dan sedikit kerusakan pada tubuh. Sebagai contoh, dosis yang diserap oleh pasien untuk pemeriksaan sistouretroskopi kedokteran nuklir hanya 1% dari dosis sistografi sinar-X, sehingga aman bagi pasien, apalagi pencitraan kedokteran nuklir. Selain itu, proses pemeriksaan kedokteran nuklir hanya berupa suntikan radiofarmasi secara intravena atau oral, yang sering kali berukuran sangat kecil dan tidak menimbulkan risiko cedera dan rasa sakit yang disebabkan oleh intubasi dan operasi lainnya. Meskipun demikian, kedokteran nuklir memiliki persyaratan dan peraturan yang ketat untuk meminimalkan terjadinya reaksi yang merugikan.