Pengukuran fungsional kedokteran nuklir sekitar beberapa puluh dolar, tes pencitraan sebagian besar beberapa ratus dolar, tetapi ada juga tes yang harganya beberapa ribu dolar atau bahkan sekitar sepuluh ribu dolar, yang secara intuitif terasa sangat mahal. Harganya sangat tergantung pada biaya. Apakah tes yang mahal tersebut sepadan dengan manfaatnya, tergantung pada seberapa berguna tes tersebut dalam keseluruhan proses diagnosis dan perawatan, serta apakah tes tersebut pada akhirnya menghemat atau membebani pasien. Sebagai contoh, pencitraan tulang seluruh tubuh dalam kedokteran nuklir adalah metode yang sangat sensitif untuk deteksi dini metastasis tulang dari tumor, dan biayanya beberapa ratus dolar untuk satu kali pemeriksaan. Namun, alat ini dapat digunakan untuk mendeteksi metastasis tulang pada tahap awal dan dapat menghindari pembedahan yang tidak perlu. Biaya untuk mengurangi operasi yang tidak perlu jauh lebih besar daripada biaya pencitraan tulang. Belum lagi kerusakan yang tak terukur yang disebabkan oleh pasien jika operasi dilakukan yang seharusnya tidak dilakukan. Sebagai contoh, pencitraan nuklir perfusi miokard pada pasien dengan penyakit arteri koroner akan memungkinkan banyak pasien menghindari intervensi kateter yang tidak perlu. Pemeriksaan kedokteran nuklir membutuhkan biaya sekitar $2.000, sementara intervensi kateter sering kali membutuhkan biaya puluhan ribu dolar. Mengurangi risiko restenosis akibat kateterisasi dan terjadinya restenosis setelah prosedur bahkan lebih penting lagi bagi prognosis pasien. Oleh karena itu, biaya tes tidak dapat diukur hanya dengan biaya tes, tetapi biasanya dengan “nilai uang”. Daripada apakah tes ini mahal, sering kali lebih baik mempertimbangkan apakah tes ini bermanfaat. Di banyak negara maju, peran tes kedokteran nuklir dalam keputusan pengobatan ditanggapi dengan sangat serius, dan banyak pengobatan penting, seperti operasi onkologi dan pemasangan stent untuk penyakit jantung koroner, memerlukan tes kedokteran nuklir sebelum dilakukan, jika tidak, maka pengobatan tersebut dianggap tidak masuk akal dan perusahaan asuransi tidak akan membiayainya.