Bakteri yang menginfeksi radang usus buntu terutama adalah E. coli, enterococci, streptococci, bakteri feses dan bakteri anaerobik dari saluran usus, yang secara medis diklasifikasikan sebagai bakteri Gram-negatif. Antibiotik efektif yang paling umum digunakan untuk bakteri Gram-negatif adalah penisilin dan sefalosporin, tetapi dengan meluasnya penggunaan antibiotik dalam kehidupan sehari-hari, resistensi penisilin menjadi semakin umum dan oleh karena itu antibiotik pilihan yang direkomendasikan secara klinis untuk pengobatan apendisitis adalah sefalosporin. Baik obat usus buntu pasca-appendektomi maupun konservatif lebih disukai daripada antibiotik sefalosporin, yang umum digunakan adalah antibiotik sefalosporin generasi kedua dan ketiga seperti cefamandole, cefmetazole, cefuroxime, ceftazidime, cefoperazone, dll.