Enterobacteriaceae
Enterobacteriaceae tersebar luas dan memiliki kisaran inang yang besar. Mereka parasit atau simbiotik, epifit dan saprofit pada manusia, hewan dan tumbuhan, dan juga dapat hidup di tanah atau air, dan berhubungan erat dengan manusia. Enterobacteriaceae mudah dikultur dan berkembang biak dengan cepat (1 generasi setiap 20-30 menit dalam kondisi yang sesuai). Beberapa spesies, seperti E. coli, merupakan bahan penting untuk studi genetika dan biologi molekuler.
Enterobacteriaceae termasuk basil lurus negatif pewarnaan Gram tanpa basil, flagela melingkar atau tanpa flagela. Ini adalah nutrisi organik kemo-energetik dengan metabolisme pernapasan dan fermentatif; ia dapat memperoleh energi dengan mengoksidasi berbagai senyawa organik sederhana atau memfermentasi gula, asam organik atau poliol; sebagian besar spesies dapat tumbuh pada media nitrogen anorganik yang mengandung sumber karbon;
Beberapa spesies memerlukan asam amino tertentu atau vitamin yang larut dalam air untuk pertumbuhannya; enzim kontak positif dan oksidase negatif, kecuali untuk beberapa serotipe; nitrat direduksi menjadi nitrit, kecuali untuk beberapa spesies dalam genus Owenella; kandungan molekul gram G+C (guanin dan sitosin) DNA (asam deoksiribonukleat) adalah 39 sampai 59%.
Dasar klasifikasi
Reaksi fermentasi dan reaksi serologis merupakan dasar penting untuk klasifikasi bakteri dalam keluarga Enterobacteriaceae. Ada dua jalur utama untuk fermentasi gula: satu di mana produk akhir utama metabolisme adalah asam organik campuran, termasuk asam suksinat, asam laktat, asam asetat, dan asam format; dan yang lainnya di mana produk akhir utama metabolisme adalah pelarut netral, termasuk etanol dan butilen glikol. Pada jalur yang pertama, jika terdapat dehidrogenase asam format, bakteri memfermentasi gula untuk menghasilkan karbon dioksida dan hidrogen dalam jumlah yang cukup banyak dengan rasio 1:1.
Jalur yang terakhir menghasilkan karbon dioksida ketika butanediol terbentuk dan rasio karbon dioksida terhadap hidrogen lebih besar dari 1. Deteksi jalur fermentasi dan kemampuan menggunakan gula tertentu untuk fermentasi merupakan dasar penting untuk pengelompokan Enterobacteriaceae ke dalam clades dan genera.
Sistem taksonomi
Sejak tahun 1937, ketika Rahn mengusulkan pembentukan Enterobacteriaceae, kisaran genera yang termasuk di dalamnya telah berubah beberapa kali. Secara umum, famili ini dibagi menjadi 5 famili dan 12 genera, dan ciri-ciri pengidentifikasian utama dari masing-masing famili dan genus ditunjukkan dalam tabel di bawah ini.
Fitur pembeda utama
Clade dan genus G + C gram molekuler % suhu pertumbuhan optimum daya produk fermentasi terhadap fermentasi laktosa dari produksi gas gula Keterangan
1. Clade Ehrlichia
Genus ①Eichia 50-53 37°C asam campuran + + + + + patogen enterik
Edwardsella spp. 50-53 37°C asam campuran + – + patogen enterik
(iii) Citrobacter spp. 50-53 37°C asam campuran + + + + patogen enterik
Salmonella spp. 50-53 37°C asam campuran + – + patogen enterik
Shigella spp. 50-53 37°C asam campuran – kebanyakan negatif – enteropatogenik
2.Kelompok Klebsiella
Klebsiella spp. 52-59 37°C Pelarut netral – ± + patogen pernapasan, penghasil pigmen merah
Enterobacter spp. 52-59 37°C Pelarut netral + + + + + + Patogen pernapasan, penghasil pigmen merah
(iii) Haffneyella spp. 52-59 37°C Pelarut netral + + (terlambat) + patogen pernapasan, penghasil pigmen merah
(iv) Serratia spp. 52-59 37°C Pelarut netral + ± (terlambat) ± patogen saluran pernapasan, penghasil pigmen merah
3.Kelompok Amoeba
Amoeba spp. 39-42 37°C Asam campuran dan pelarut netral + – +
4.Yersinia pestis
Yersinia spp. 45-47 30-37°C asam campuran ± sebagian besar negatif (terlambat) – patogen hewan pengerat dan manusia
5. Owenella spp.
(1) Owenella spp. 50-58 27-30°C asam campuran dan pelarut netral + – ± bakteri patogen tanaman +: positif; ±: sebagian besar positif; -: negatif[1] Spesies umum
Escherichia coli
(1) Escherichia spp.: mencakup lima spesies, yaitu Escherichia coli, Escherichia cockroach, Escherichia fergusonii, Escherichia hermannii dan Escherichia wounderi. Rasio GC DNA bakteri dalam genus ini adalah 48% hingga 52%. Spesies klinis yang paling umum adalah Escherichia coli. Escherichia coli umumnya dikenal sebagai E. coli dan sebagian besar strain adalah flora normal usus manusia dan hewan. Patogenisitas: terutama invasi, endotoksin, enterotoksin dan faktor patogenik lainnya yang menyebabkan berbagai kondisi inflamasi (misalnya kolesistitis, infeksi saluran kemih, pneumonia, meningitis neonatal, infeksi luka, bakteremia dan diare). Endotoksin juga dapat menyebabkan demam, syok, DIC, dll.
Salmonella spp.: ukuran bakteri (0,6-0,9) mikron × (1-3) mikron, tidak ada spora, umumnya tidak ada polong, kecuali Salmonella disentri ayam dan Salmonella tifus ayam, sebagian besar lingkar flagel. Salmonella ditularkan melalui saluran pencernaan hewan dan secara kolektif dikenal sebagai salmonellosis. Jenis penyakitnya adalah tifoid dan paratifoid (secara kolektif disebut demam enterik), keracunan makanan, septicaemia, dan juga dapat menyebabkan enteritis kronis.
Shigella: Genus ini adalah agen penyebab disentri bakteriologis manusia dan umumnya dikenal sebagai Bacillus dysenteriae. Ukuran tubuh bakteri (0,5-0,7) mikron × (2-3) mikron, tidak ada spora, tidak ada flagel, tidak ada polong, beberapa strain memiliki rambut, aerobik atau sebagian anaerobik, dapat tumbuh pada media biasa.
Klebsiella spp.: pendek dan tebal, tidak ada flagel, dengan polong-polong, ukuran bakteri (0,3-1,5) mikron × (0,6-6,0) mikron, susunan rantai tunggal, ganda atau pendek, sebagian anaerobik, kebutuhan nutrien tidak tinggi, dalam medium padat membentuk koloni seperti lendir yang khas. Ini ditemukan di alam seperti tanah, air, sereal dan di saluran pernapasan manusia atau hewan. Apabila kekebalan otot berkurang, hal ini dapat menyebabkan berbagai infeksi. Ada tiga spesies Klebsiella pneumoniae, Klebsiella odorata dan Klebsiella nasalis.
Serratia spp.: menghasilkan pigmen kuning, ungu dan merah yang tidak larut dalam air. Secara umum ditemukan di tanah, air, tanaman, hewan, dan di dalam usus dan saluran pernapasan manusia. Ada Serratia berlendir, Serratia liquefaciens dan Serratia crimsonis. Serratia marcescens, juga dikenal sebagai Listeria monocytogenes, adalah bakteri terkecil, dikelilingi oleh flagela, motil, tanpa polong, tanpa spora tunas, dan sekitar setengah dari strain dapat menghasilkan Listeria monocytogenes merah. Karena bakterinya kecil dan berpigmen, sering digunakan untuk memeriksa kualitas filter.
(6) Genus Anaplasma: golongan batang kecil tanpa tunas, tanpa polong, flagela melingkar, motil, tumpul dan membulat pada kedua ujungnya. Ukuran tubuh bakteri (0,4 ~ 0,6) mikron × (1,0 ~ 3,0) mikron, anaerobik paruh waktu, air, tanah, selokan, dan berbagai hewan dan tanaman busuk di sebagian besar, mereka adalah bakteri patogen bersyarat, dalam keadaan khusus dapat membuat orang sakit.
(7) Yersinia pestis: oval, batang pendek. Ukuran bakteri adalah (0,5 hingga 1,0) mikron x (1,0 hingga 2,0) mikron. Tidak ada bakteri, tidak ada polong, sebagian anaerobik. Genus ini memiliki tiga spesies wabah Mycobacterium, Mycobacterium pseudotuberculosis dan Mycobacterium enterocolitica. Mycobacterium plague adalah agen penyebab wabah. Wabah sering terjadi pada hewan pengerat sebelum wabah ini terjadi pada populasi. Ketika manusia terkena wabah, itu dapat menyebar pada manusia melalui kutu manusia atau saluran pernapasan (tipe paru).