Gejala klinis biasanya tidak muncul setelah tiga hari infeksi HIV, tetapi biasanya 2-4 minggu setelah infeksi HIV awal. Manifestasi klinis terutama terlihat sebagai gejala yang disebabkan oleh viraemia dan kerusakan akut pada sistem kekebalan tubuh. Sebagian besar pasien memiliki gejala klinis yang relatif ringan yang berlangsung 1-3 minggu dan kemudian sembuh. Demam adalah gejala yang paling umum pada saat ini, disertai dengan sakit tenggorokan, keringat malam, mual, muntah, diare, ruam, nyeri sendi, pembengkakan kelenjar getah bening, dan gejala neurologis. Pasien yang berkembang pesat dapat mengalami infeksi parah, atau tanda dan gejala sistem saraf pusat, dan penyakit terkait selama periode ini. Manifestasi di atas juga dapat disebut fase akut infeksi HIV. Pasien dapat beralih dari fase akut ke fase asimtomatik, atau langsung ke fase asimtomatik tanpa gejala fase akut yang jelas.