Duodenitis yang disebabkan oleh H. pylori memerlukan pengobatan eradikasi H. pylori. Obat antibiotik yang umum digunakan termasuk amoksisilin, metronidazol/tennidazol, furazolidon, tetrasiklin dan klaritromisin. Dua atau lebih antibiotik biasanya dikombinasikan dengan antasida untuk membentuk terapi triple dan quadruple. Obat PPI seperti omeprazole dan pantoprazole sering dipilih sebagai penekan asam. Pasien dapat menggunakan obat bismut dalam kombinasi untuk melindungi mukosa lambung.