Dispepsia fungsional biasanya tidak menyebabkan tinja berwarna hitam. Tinja hitam biasanya menunjukkan adanya perdarahan saluran cerna, biasanya disebabkan oleh penyakit organik saluran cerna, penyakit jinak termasuk ulkus duodenum, ulkus gaster dan gastritis, dan penyakit ganas termasuk kanker lambung dan kanker kolorektal. Jika pasien berusia >40 tahun dan disertai dengan wasting, anemia atau memiliki riwayat keluarga dengan tumor gastrointestinal, kemungkinan penyakit organik saluran pencernaan harus diperhatikan dan perawatan medis yang cepat dianjurkan.