Peptida natriuretik urin tipe-b yang tinggi harus diobati terutama dengan mengurangi beban jantung dan menghilangkan pemicu yang menyebabkan gagal jantung. Peningkatan peptida natriuretik urin tipe-b paling sering terlihat pada pasien dengan gagal jantung akut. Semakin tinggi kadarnya, semakin parah gagal jantungnya dan semakin besar risikonya bagi pasien. Pasien dengan gagal jantung harus menyadari kebutuhan untuk mengurangi beban jantung, dan perlu diberikan terapi diuretik, seperti furosemid dan spironolakton, untuk mengeluarkan kelebihan air dari tubuh, dan perubahan elektrolit perlu dipantau selama pemberian obat. Gagal jantung sebagian besar disebabkan oleh infeksi paru-paru, dan pasien yang jelas-jelas menderita infeksi paru-paru harus diberikan obat anti infeksi, seperti antibiotik penisilin. Pasien dengan insufisiensi ginjal mungkin juga mengalami peningkatan peptida natriuretik otak tipe-b, dan perawatan harus dilakukan untuk melindungi fungsi ginjal. Kadar peptida natriuretik urin tipe-b akan berangsur-angsur menurun setelah gejala gagal jantung membaik, dan beberapa pasien dapat kembali normal sepenuhnya. Pasien dengan gagal jantung kronis memerlukan terapi obat oral jangka panjang dan pemantauan kadar peptida natriuretik urin tipe-b.