Refluks empedu dapat terjadi setelah pyloromyotomy lambung. Refluks empedu ini merupakan komplikasi pasca operasi pyloromyotomy lambung dan tidak dapat disembuhkan, dan dapat diatasi dengan makan lebih sedikit dan lebih sering serta cara-cara lain untuk meredakan refluks asam. Pilorus adalah bagian lambung yang berkomunikasi dengan duodenum dan dikelilingi oleh cincin otot yang tebal untuk membentuk sfingter pilorus, yang merupakan bagian tersempit dari saluran pencernaan, dan memiliki fungsi untuk menjaga tekanan di perut dan mencegah refluks sisa makanan dan empedu dari duodenum. Setelah pyloromyotomy lambung, refluks empedu terjadi karena hilangnya fungsi pilorus, dan dimanifestasikan sebagai refluks asam. Refluks empedu setelah pyloromyotomy lambung disebabkan oleh komplikasi operasi dan tidak dapat disembuhkan sepenuhnya, tetapi gejala refluks masih dapat diredakan dengan makan dalam porsi kecil dan sering serta tidak berbaring setelah makan, selain penggunaan obat-obatan seperti domperidone untuk meredakan gejala refluks.