Non-invasif mengacu pada pengujian DNA non-invasif. Noninvasif untuk janin kembar pada awalnya dapat menentukan apakah janin memiliki kelainan genetik, tetapi ada tingkat negatif palsu untuk janin kembar karena pencampuran gen pada janin kembar. DNA non-invasif dapat menentukan apakah janin memiliki trisomi 18 atau trisomi 21 dengan memantau fragmen DNA janin dalam darah tepi ibu. Jika terdeteksi adanya kelainan genetik, maka kehamilan dapat diakhiri lebih awal agar bayi tidak lahir dengan kelainan genetik yang serius. Tingkat pengujian DNA non-invasif untuk kehamilan kembar monozigot sama dengan kehamilan kembar monozigot, tetapi dalam kasus kehamilan kembar dizigot jika jumlah DNA yang bebas dari janin normal melebihi jumlah DNA dari janin abnormal, hal ini dapat mengakibatkan hasil negatif palsu. Ibu dengan kehamilan kembar yang ingin mengetahui apakah janinnya memiliki kelainan genetik disarankan untuk mengunjungi pusat diagnostik antenatal untuk pemeriksaan amniosentesis atau darah tali pusat.