Sebagian besar hasil patologi parafin dan patologi beku tidak jauh berbeda, tetapi mungkin ada beberapa perbedaan dalam hasil karena keterbatasan waktu, keterbatasan jumlah sampel yang diambil, dan efek persiapan.
1. Batasan waktu: laporan patologi beku intraoperatif dikeluarkan dengan batasan waktu dan umumnya membutuhkan sekitar 30 menit untuk mengeluarkan laporan patologi, sedangkan laporan patologi parafin rutin pasca operasi memiliki batasan waktu yang lebih sedikit dan umumnya membutuhkan 5-10 hari untuk mengeluarkan laporan patologi. Waktu tes yang terburu-buru dapat menyebabkan kesalahan dalam tes patologi beku, sehingga hasilnya tidak sesuai dengan laporan patologi parafin.
2. Batasan jumlah bahan: Untuk mempersingkat waktu pengujian, jumlah bahan yang diambil untuk laporan patologi beku intraoperatif dibatasi, dan jumlah jaringan yang diekstraksi lebih sedikit, sedangkan laporan patologi parafin pasca operasi dapat digunakan untuk lebih banyak bahan uji. Keterbatasan jumlah jaringan yang diekstraksi juga dengan mudah mengarah pada tes patologi beku intraoperatif, dan ada situasi kelalaian atau kesalahan diagnosis, yang mengarah pada ketidaksesuaian antara hasilnya dan hasil laporan patologi parafin pasca operasi.
3. Efek persiapan: Laporan patologi beku terutama disiapkan dengan membekukan bagian tanpa dehidrasi yang efektif, sedangkan laporan patologi parafin perlu disiapkan dengan membelah setelah dehidrasi yang cukup, yang lebih kondusif untuk pengamatan jaringan yang diuji.
Oleh karena itu, terdapat perbedaan akurasi di antara keduanya, dengan laporan patologi parafin memiliki tingkat akurasi hingga 98% dan laporan patologi beku memiliki tingkat akurasi sekitar 95%.
Jika terdapat perbedaan besar antara hasil tes laporan patologi parafin pasca operasi dan laporan patologi beku intra operasi, maka hasil laporan parafin pasca operasi biasanya diambil sebagai referensi utama.