Jika antibiotik digunakan dengan bijak, manfaatnya umumnya lebih besar daripada kerugiannya, meskipun membutuhkan waktu yang lebih lama; jika antibiotik disalahgunakan, hal itu dapat menyebabkan resistensi antibiotik, kerusakan fungsi hati dan ginjal, dan infeksi sekunder. Antibiotik terutama digunakan untuk mengobati penyakit menular. Penggunaan antibiotik yang wajar untuk menargetkan penyebab penyakit dapat mengendalikan kondisi dengan sangat cepat dan sangat membantu untuk pemulihan. Jika antibiotik digunakan terlalu banyak, tetapi masih dalam kisaran yang wajar, manfaatnya bagi tubuh manusia lebih besar daripada kerugiannya. Penggunaan antibiotik yang berlebihan telah melebihi jumlah yang dibutuhkan untuk pengobatan, termasuk dalam penyalahgunaan antibiotik, situasi ini dapat menyebabkan resistensi antibiotik, sedangkan antibiotik yang berlebihan melebihi kemampuan tubuh untuk bertahan, dapat menyebabkan kerusakan fungsi hati dan ginjal. Sejumlah kecil orang dengan resistensi rendah dapat mengalami infeksi ganda, seperti menginduksi infeksi jamur dan infeksi virus. Dianjurkan untuk menggunakan antibiotik secara wajar di bawah bimbingan dokter.