Umumnya, gastroskopi tidak merusak, tetapi risiko seperti alergi, kerusakan tenggorokan, dan pendarahan tidak dapat dikesampingkan. Gastroskopi adalah pemeriksaan dengan memasukkan tabung dengan kamera ke dalam perut untuk mengamati lesi pada kerongkongan, lambung, bola duodenum, dll. Pemeriksaan ini dapat digunakan untuk mendiagnosis refluks esofagitis, gastritis, tukak lambung, tukak duodenum, dan penyakit lainnya. Biopsi patologis serta pengangkatan polip dapat dilakukan selama pemeriksaan. Secara umum, gastroskopi tidak berbahaya, tetapi tidak mengecualikan gejala kerusakan gastroskopi pada tenggorokan, sakit tenggorokan, suara serak dan gejala lainnya selama pemeriksaan, dan juga dapat menyebabkan kerusakan selaput lendir di perut, kerongkongan dan bagian lain dari perut, sakit perut, muntah darah, darah di tinja, tinja hitam dan komplikasi lainnya. Selain itu, terdapat risiko alergi, depresi pernapasan dan efek samping lainnya selama gastroskopi tanpa rasa sakit. Dianjurkan untuk segera mencari pertolongan medis jika terjadi ketidaknyamanan.