Septum pellucidum adalah nama yang diberikan untuk struktur dalam otak janin. Septum yang hilang adalah struktur penting dalam otak janin, yang umumnya dikaitkan dengan kelainan mental atau sensorik dan memerlukan pemeriksaan lebih lanjut untuk memastikan diagnosis. Septum transparan merupakan struktur penting otak janin hasil pemeriksaan USG, pada pemeriksaan USG kehamilan, ditemukan hilangnya septum transparan janin, perlu dilakukan pemeriksaan MRI tengkorak janin lebih lanjut, bila perlu dilakukan pengambilan cairan ketuban untuk pemeriksaan kromosom, guna mengetahui adanya kelainan kromosom pada janin. Hilangnya septum pellucidum sebagian besar terlihat pada perkembangan abnormal pusat otak janin atau retardasi mental, yang harus ditangani sesegera mungkin.