Biasanya sulit untuk kembali normal setelah operasi kraniofaringioma, dan biasanya terdapat komplikasi yang lebih nyata, seperti urolitiasis dan gangguan elektrolit darah. Pembedahan kraniofaringioma merupakan salah satu prosedur bedah saraf yang lebih sulit, dan sulit untuk mencapai reseksi total tumor, yang pada sebagian besar kasus hanya berfungsi untuk meringankan gejala peningkatan tekanan intrakranial, hipoplasia endokrin, dan gangguan penglihatan pada pasien. Angka kematian pada operasi pertama untuk kraniofaringioma pada anak-anak adalah sekitar 2%, terutama karena cedera hipotalamus yang parah. Komplikasi yang disebabkan oleh cedera hipotalamus terutama meliputi uremia, gangguan elektrolit, epilepsi, dll., Di mana kemungkinan uremia adalah sekitar 91%, dan kemungkinan gangguan elektrolit darah adalah sekitar 89%, sedangkan komplikasi jangka panjang lainnya adalah obesitas hipotalamus, yang terlihat pada sekitar 50% atau lebih anak-anak. Singkatnya, umumnya sulit untuk kembali ke kondisi fisik semula setelah operasi craniopharyngioma, tetapi masih perlu mengikuti instruksi dokter untuk perawatan yang wajar, dan munculnya konsultasi tepat waktu yang tidak tepat.