Tumor jinak juga dapat menyebabkan rasa sakit dalam keadaan tertentu. Kita semua tahu bahwa tumor ganas dapat menyebabkan nyeri kanker, tetapi sebenarnya tumor jinak juga dapat menyebabkan nyeri. Sebagai contoh, lipoma subkutan, ketika tumbuh mencapai ukuran tertentu, dapat menekan sistem saraf tepi dan menyebabkan nyeri neuropatik. Teratoma jinak ovarium dapat menyebabkan nyeri perut yang parah jika terjadi torsi pada ujungnya. Teratoma jinak merupakan penyebab umum abdomen akut dan memerlukan penanganan segera, jika tidak, teratoma ini dapat menyebabkan nekrosis, ruptur, dan perdarahan, yang dapat mengancam jiwa. Selain itu, beberapa tumor jinak dapat menyebabkan peradangan jaringan, yang juga dapat menyebabkan rasa sakit. Sebagai contoh, tumor jinak pada payudara sering menyumbat saluran payudara, yang menyebabkan duktitis dan menyebabkan rasa sakit yang signifikan. Terakhir, beberapa tumor jinak yang berasal dari neurologis dapat menyebabkan rasa sakit, seperti tumor jinak selubung saraf, yang berasal dari jaringan selubung saraf dan dapat menyebabkan rasa sakit yang parah. Kesimpulannya, tumor jinak juga dapat menyebabkan rasa nyeri dan ada atau tidaknya rasa nyeri tidak dapat digunakan sebagai penanda untuk membedakan antara tumor jinak dan ganas.