Sehari sebelum kolonoskopi, pasien harus memperhatikan pola makannya, seperti makan makanan yang tidak mengandung remah-remah, dan lain-lain, serta minum obat pencahar enam jam sebelum pemeriksaan. Kolonoskopi dapat memberikan gambaran usus dari berbagai arah, sehingga dapat membantu dalam mendiagnosis penyakit usus. Waktu persiapan sebelum kolonoskopi relatif lama. Pasien tanpa riwayat sembelit harus mencoba makan makanan tanpa ampas seperti sup nasi, susu kedelai, dll. Sehari sebelum pemeriksaan, dan pasien dengan riwayat sembelit harus makan makanan tanpa ampas sekitar dua atau tiga hari sebelum pemeriksaan. Biasanya, obat pencahar oral seperti manitol dan dispersi elektrolit polietilen glikol dimulai enam jam sebelum dimulainya kolonoskopi untuk membersihkan usus hingga feses berwarna kuning atau encer. Selain itu, sebelum kolonoskopi, pasien harus menjaga perut tetap kosong, rileks, dan secara aktif bekerja sama dengan dokter untuk mempersiapkan kolonoskopi. Dianjurkan untuk menggunakan obat di bawah bimbingan dokter, tidak mengobati sendiri secara membabi buta untuk menghindari efek samping.