Nyeri usus biasanya terjadi di sekitar pusar, yang merupakan bagian tengah usus, yang meliputi jejunum, ileum, usus besar dan rektum. Ketika nyeri usus terjadi, lokasi nyeri dapat dipengaruhi oleh adanya lesi pada saluran usus yang berbeda. Karena jejunum dan ileum usus halus terutama berada di sekitar pusar, ketika lesi terjadi di usus halus, nyeri di sekitar pusar adalah manifestasi utama. Usus besar berada di pinggiran usus halus, jadi ketika ada lesi di usus besar, rasa sakitnya lebih jauh ke pusar. Ketika lesi tidak terjadi pada kolon asendens, sisi kanan perut adalah tempat utama nyeri, ketika lesi terjadi pada kolon transversal, rasa sakit terutama di bagian melintang perut bagian atas, dan pada kolon desendens, sisi kanan perut adalah tempat utama. Usus buntu juga merupakan bagian dari saluran usus dan ketika meradang, usus buntu juga dapat menyebabkan rasa sakit pada usus, terutama di perut bagian kanan bawah. Ketika penyakit usus terdapat di daerah sigmoid dan rektum, rasa sakitnya terutama di perut bagian kiri bawah.