Pelana kupu-kupu kosong tidak memerlukan pengobatan karena tidak ada obat untuk mengobati pelana kupu-kupu kosong. Beberapa pasien dengan pelana kupu-kupu kosong tidak mengalami gejala klinis dan tidak memerlukan pengobatan. Setelah gejala muncul, seperti sakit kepala, obesitas, dan kehilangan penglihatan, pembedahan sering kali diperlukan untuk pengobatan. Pada orang normal, ketika jaringan hipofisis pada pelana kupu-kupu kosong menyusut, jaringan tersebut akan ditempati oleh vesikula dan pelana kupu-kupu kosong akan terbentuk. Pembentukan pelana kupu-kupu kosong umumnya disebabkan oleh dua kondisi. Pertama, disebabkan oleh bawaan, karena lubang pusat bawaan relatif besar, yang akan menyebabkan hernia subaraknoid, menekan jaringan hipofisis, sehingga membentuk pelana kupu-kupu kosong. Kedua, kelainan endokrin tubuh akan menyebabkan pembengkakan pada jaringan hipofisis, yang akan menyebabkan munculnya pelana kupu-kupu kosong. Pengobatan umumnya adalah dengan menggunakan pilihan pengobatan bedah invasif minimal, biayanya 30.000-50.000, pengobatan konservatif dianjurkan.