Anencephaly dapat disebabkan oleh mutasi genetik atau kelainan kromosom, dan yang kedua, hal ini juga terkait dengan faktor lingkungan. Anencephaly adalah jenis malformasi tabung saraf, yang mengacu pada hilangnya otak, kulit kepala, dan tengkorak tengkorak secara keseluruhan, dengan hanya jaringan ikat fibrosa seperti inti basal yang menutupi tengkorak, dan bayi tidak dapat bertahan hidup secara normal setelah lahir. Anencephaly disebabkan oleh sejumlah faktor genetik dan lingkungan selama masa embrio, yang mengakibatkan penutupan tabung saraf yang tidak sempurna dan pembentukan anencephaly. Faktor genetik mengacu pada malformasi yang disebabkan oleh kelainan pada materi genetik orang tua. Penyebab umumnya adalah kelainan kromosom pada orang tua, orang tua yang membawa gen yang tidak normal, dan mutasi pada gen janin. Faktor lingkungan dapat mempengaruhi embrio secara langsung atau tidak langsung, seperti paparan zat kimia pada awal kehamilan, perokok berat, kecanduan alkohol, mengonsumsi obat-obatan yang dilarang selama kehamilan, yang berdampak lebih besar pada sistem saraf selama minggu ketiga dan keempat perkembangan embrio, dan kemungkinan besar dapat menyebabkan cacat janin. Baik pria maupun wanita harus melakukan pemeriksaan pra-kehamilan dengan baik sebelum hamil, mempersiapkan kehamilan setelah tiga bulan sebelum hamil, mencoba untuk mencapai eugenika, tetapi juga pemeriksaan kebidanan secara teratur.