Intoleransi laktosa akibat diare bersifat sekunder dan waktu pemulihannya bervariasi tergantung pada individu, biasanya 2-8 minggu. Infeksi bakteri, virus atau parasit usus dapat menyebabkan diare kronis, menyebabkan kerusakan yang luas pada sel epitel usus dan mempengaruhi vili mukosa usus, yang tidak dapat mengeluarkan enzim laktase, sehingga sebagian laktosa tidak dapat diuraikan dan diserap, yang menyebabkan intoleransi laktosa sekunder. Vili yang rusak pada epitel usus biasanya perlu diperbaiki dalam 2-8 minggu, dan pada saat itu sekresi laktase akan berangsur-angsur kembali normal. Tergantung pada kondisi fisik individu, mungkin diperlukan waktu setidaknya 2 minggu untuk pasien yang pulih dengan cepat dan hingga 2 bulan untuk pasien yang pulih dengan lambat. Jika diare menyebabkan intoleransi laktosa, disarankan untuk pergi ke rumah sakit sesegera mungkin untuk mendapatkan perawatan yang ditargetkan di bawah bimbingan dokter.