Efek samping utama zonisamide adalah kehilangan nafsu makan, mengantuk, dan kelelahan. Zonisamide terutama digunakan untuk kejang grand mal, kejang terbatas, kejang petit mal, dan status epileptikus. Efek samping dari zonisamide termasuk kantuk, kelemahan umum, kehilangan nafsu makan, dll. Beberapa pasien mungkin mengalami diskinesia, peningkatan aminotransferase, penurunan sel darah putih, dan diplopia serta reaksi lainnya pada beberapa pasien. Saat menggunakan obat perlu memperhatikan, penggunaan obat secara terus menerus tidak bisa tiba-tiba menghentikan atau mengurangi dosis, perlu secara teratur meninjau fungsi hati dan ginjal pasien, wanita menyusui harus berhati-hati. Produk ini dapat menyebabkan penurunan perhatian dan kemampuan motorik refleks, sehingga pengemudi, operator mesin harus digunakan dengan hati-hati. Disarankan agar pasien mengikuti petunjuk dokter untuk menghindari perburukan kondisi.