Ubun-ubun yang cekung dapat diakibatkan oleh hilangnya air dalam tubuh, malnutrisi yang disebabkan oleh pemberian makan yang buruk, yang juga dapat mengakibatkan ubun-ubun cekung, atau dapat juga diakibatkan oleh penyakit lain yang ditularkan di dalam rahim ibu. Dehidrasi sering terjadi setelah muntah atau diare. Ketika tubuh kehilangan lebih banyak air, terjadi ketidakseimbangan pertukaran cairan serebrospinal antara tengkorak dan jaringan darah tubuh, dan cairan serebrospinal menurun, mengakibatkan tekanan yang lebih rendah dan ubun-ubun cekung. Hal ini dapat berbahaya jika rehidrasi tidak dilakukan tepat waktu. Selain itu, malnutrisi yang disebabkan oleh pemberian makanan yang buruk juga dapat menyebabkan ubun-ubun cekung, dan penting untuk meningkatkan nutrisi anak dalam kehidupan sehari-hari.