Reseksi usus kecil biasanya memerlukan anestesi umum, dan setelah reseksi kolateral usus yang sesuai melalui lubang perut, usus tersebut disterilkan, disambung dan dijahit.
Reseksi usus kecil dapat dilakukan dengan menggunakan sayatan apa pun di perut. Sayatan yang lebih umum digunakan adalah sayatan otot rektus abdominis. Segmen usus yang dipilih untuk reseksi diangkat, pembuluh darah yang memasok darah dijepit dengan forsep vaskular dan dipotong, diikat atau dijahit dengan benang yang tidak dapat diserap, diikuti dengan pemisahan mesenterium, yang dipisahkan dengan benar sehingga saluran usus yang akan direseksi tidak mengandung banyak isi.
Area di mana usus akan dipotong kemudian dilapisi dengan kain kasa dan diisolasi dari jaringan di sekitarnya untuk meminimalkan kontaminasi. Usus juga dipotong di sepanjang tang vaskular bergigi, dan loop usus yang telah direseksi dikeluarkan dari meja operasi bersama dengan mesenterium. Mukosa dari ujung usus kecil yang diawetkan kemudian disterilkan dengan uap yodium dan akhirnya disambung dan dijahit.
Disarankan agar pasien yang akan menjalani reseksi usus halus tidak terlalu cemas, rileks, dan secara aktif menyelesaikan pemeriksaan yang relevan dan bekerja sama dengan dokter untuk perawatan.