Ensefalitis pada anak-anak adalah sakit kepala yang sangat mengkhawatirkan bagi para orang tua, karena ada bagian otak yang berbeda dan jenis infeksi yang berbeda, sehingga gejala dan pengobatannya juga sangat berbeda. Ensefalitis terutama merupakan gejala inflamasi parenkim otak, dan anak-anak yang menderita ensefalitis akan memiliki manifestasi sistemik seperti demam, muntah, mual, atau lemas, yang harus ditanggapi secara serius oleh orang tua, karena banyak orang tua yang tidak memahami ensefalitis mungkin salah mengira bahwa itu adalah flu biasa. Untuk ensefalitis difus, anak akan mengalami demam tinggi dengan koma dan kejang-kejang. Untuk ensefalitis dengan lesi di batang otak, gejalanya akan bervariasi, terutama mati rasa pada anggota badan, kesulitan menelan dan kelumpuhan saraf wajah, dan bahkan afasia. Bentuk ensefalitis kedua yang paling umum adalah pseudotumour, dengan gejala-gejala seperti kelumpuhan, afasia dan hipertensi intrakranial. Hanya pada sejumlah kecil anak kecil yang memiliki gejala miokarditis. Hal ini bisa disertai dengan kejang-kejang, kebingungan dan mengantuk. Ini adalah beberapa gejala yang dapat ditemukan pada beberapa anak yang menderita ensefalitis. Semakin cepat mereka terdeteksi, semakin sedikit bahaya yang akan mereka alami. Setiap anak memiliki gejala yang berbeda, jadi penting untuk mencari perhatian medis dini untuk setiap kelainan.