MRI dan CT memiliki keunggulan masing-masing, MRI memiliki resolusi tinggi untuk jaringan lunak dan CT memiliki resolusi tinggi untuk kepadatan jaringan. Dalam pemeriksaan klinis pemeriksaan resonansi magnetik nuklir yang utama, adalah penggunaan medan magnet yang kuat sehingga ion hidrogen dalam efek impuls fenomena resonansi magnetik yang dilakukan oleh teknologi pencitraan, kelebihan pemeriksaan ini adalah tidak ada radiasi, tidak akan menyebabkan kerusakan pada tubuh manusia, terutama pada jaringan lunak dengan resolusi yang lebih tinggi, dapat digunakan sebagai sistem saraf pusat dan persendian di dalam lesi pemeriksaan. Pemeriksaan CT dalam penggunaan klinis tomografi sinar-X untuk menunjukkan fokus kecil dan struktur mikro dan pencitraan rekonstruksi, pemeriksaan CT memiliki tingkat radiasi pengion tertentu, akan menyebabkan kerusakan radiasi pada tubuh manusia, CT memiliki resolusi kepadatan yang lebih tinggi, dalam resolusi kepadatan CT memiliki keunggulan yang lebih tinggi, seperti untuk resolusi fraktur tulang, pendarahan otak dan sebagainya lebih nyaman. Oleh karena itu, MRI dan CT memiliki kelebihan dan kekurangan masing-masing, sesuai dengan sifat penyakit untuk memilih metode pemeriksaan yang berbeda.