Ada berbagai jenis malformasi usus, seperti malformasi rektoanal kongenital, megakolon kongenital, serta atresia dan stenosis duodenum kongenital. Kelainan ini menimbulkan gejala yang berbeda setelah janin lahir dan sebagian besar memerlukan perawatan bedah. 1. Malformasi rektoanal kongenital: merupakan malformasi usus yang umum terjadi pada bedah anak. Manifestasi klinisnya adalah tidak ada mekonium atau sangat sedikit mekonium, bayi baru lahir menangis dan muntah, gangguan elektrolit dan gejala lainnya dapat terjadi, dan pada kasus yang parah, dapat menyebabkan nekrosis usus, perforasi usus, menyebabkan peritonitis dan kematian, yang memerlukan perawatan bedah. 2. Megakolon kongenital: merupakan penyakit bawaan yang umum terjadi pada anak-anak. Setelah lahir, janin mengalami konstipasi dan distensi abdomen. Bila konstipasi parah, gejala obstruksi usus dapat muncul, sering kali diperumit oleh gejala infeksi usus, yang biasanya memerlukan perawatan bedah. 3. Atresia dan stenosis duodenum kongenital: janin lahir dengan distensi abdomen, muntah, penyakit kuning, sembelit, dll. Muntah terus menerus dapat menyebabkan dehidrasi, gangguan elektrolit, dll., yang membutuhkan perawatan bedah. Janin dengan kelainan bentuk usus harus dikonsultasikan segera setelah lahir dan diberikan perawatan di bawah bimbingan dokter profesional, yang tidak boleh ditunda untuk menghindari konsekuensi buruk yang serius.