Tumor stroma mesenkim gastrointestinal (GIST), yang saat ini direkomendasikan untuk pembedahan, tidak direkomendasikan untuk reseksi endoskopi invasif minimal.
Terdapat kekurangan studi komparatif mengenai keamanan jangka menengah dan panjang dari reseksi endoskopi untuk GIST, sehingga tidak direkomendasikan secara rutin. Selain itu, batas antara sebagian besar tumor GIST dan jaringan otot di sekitarnya tidak terdefinisi dengan baik, sehingga reseksi endoskopi radikal tidak mudah dilakukan dan insiden komplikasi operasi (terutama perdarahan, perforasi, implantasi sel tumor, dll.) tinggi.
Pembedahan terbuka masih merupakan metode pembedahan yang paling umum digunakan untuk GIST. Reseksi segmental atau baji adalah metode eksisi lokal yang paling umum digunakan. Untuk kasus-kasus yang melibatkan pembedahan berulang atau pelestarian fungsi organ, diskusi panel ahli multidisiplin direkomendasikan untuk memutuskan apakah akan melakukan terapi imatinib pra-operasi atau tidak.
Di pusat-pusat medis yang berpengalaman, reseksi laparoskopi dapat dipertimbangkan, tergantung pada lokasi dan ukuran tumor. Jika tumor GIST memerlukan sayatan perut yang besar untuk pengangkatan total, maka pembedahan laparoskopi tidak disarankan. Pecahnya tumor dan penyebaran tumor secara intraoperatif juga harus dihindari.
Dianjurkan untuk mengatur pengobatan di bawah evaluasi dokter.