Tiroiditis Hashimoto dapat diobati dengan tablet levotiroksin dan terapi glukokortikoid seperti prednison. Pada tahap awal tiroiditis Hashimoto, hanya autoantibodi tiroid yang positif, dan tidak ada gejala klinis, dan pada tahap akhir penyakit, hipotiroidisme dapat muncul. Pengobatan klinis tiroiditis Hashimoto terutama berfokus pada hipotiroidisme dan gejala kompresi gondok. Untuk hipotiroidisme, tablet levotiroksin dapat dikonsumsi sebagai terapi pengganti. Untuk pembesaran kelenjar tiroid yang cepat dengan nyeri lokal atau gejala kompresi, terapi glukokortikoid seperti prednison dapat diberikan, dan dosisnya dapat dikurangi setelah gejalanya berkurang. Obat-obatan di atas direkomendasikan untuk digunakan di bawah pengawasan dokter, dan pasien dengan diagnosis tiroiditis Hashimoto yang telah dikonfirmasi disarankan untuk pergi ke rumah sakit tepat waktu.