Heparinisasi berguna dalam terapi trombolitik karena memiliki fungsi mencegah trombosis dan melawan infark berulang. Namun, kebutuhan heparinisasi tergantung pada kondisinya. Terapi trombolitik dapat digunakan dalam rekanalisasi farmakologis tromboemboli pada banyak organ, seperti infark serebral dan infark miokard. Saat ini di klinik, obat trombolitik yang umum digunakan adalah urokinase, streptokinase, dan aktivator fibrinogen non-spesifik lainnya. Obat-obat ini mencapai trombolisis dengan memecah fibrin dalam trombus, tetapi tidak dapat memecah fibrinogen dalam darah. Saat infark terjadi, area lokal dalam keadaan hiperkoagulasi, obat trombolitik hanya dapat menguraikan trombus yang terbentuk, tetapi tidak dapat menghambat aksi berkelanjutan dari proses koagulasi, sehingga diperlukan terapi antikoagulan dan antiplatelet untuk menghambat pembentukan trombus baru dan mencegah penyumbatan kembali. Heparin umumnya digunakan secara klinis, sehingga disebut juga heparinisasi. Namun, perlu diperhatikan bahwa waktu intervensi heparinisasi untuk infark miokard dan infark otak tidak sama; antikoagulasi dan trombolisis tidak dapat dilakukan jika terdapat risiko perdarahan dan intervensi atau pembedahan diperlukan dalam waktu singkat. Apakah dan kapan harus melakukan antikoagulasi perlu ditentukan oleh dokter sesuai dengan kondisinya.