Kehamilan dengan hipotiroidisme dapat mempengaruhi janin dan dapat menyebabkan keguguran, dan hipotiroidisme jangka panjang yang tidak diobati dapat menyebabkan kretinisme neonatal. Ketika seorang wanita hamil mengalami hipotiroidisme, hal ini dapat menyebabkan keguguran janin atau kelahiran prematur, dll. Pada kasus yang parah, hal ini dapat menyebabkan peningkatan angka kematian janin. Hipotiroidisme jangka panjang yang tidak diobati juga dapat mempengaruhi perkembangan sistem saraf janin, yang mengakibatkan keterbelakangan mental dan respons yang lambat, yang juga dikenal sebagai kretinisme, yang umumnya dikenal sebagai kretinisme. Dianjurkan agar wanita sebelum atau selama kehamilan memeriksakan kadar hormon tiroidnya secara teratur untuk mendeteksi masalah pada waktu yang tepat. Jika terdeteksi adanya masalah, maka harus diobati dengan hormon tiroid eksogen secara teratur di bawah pengawasan profesional medis. Pemeriksaan rutin juga harus dilakukan selama pengobatan untuk memastikan bahwa fungsi tiroid normal.