Reseksi mukosa endoskopik dilakukan dengan mengangkat lesi di dalam sirkumfleksa dengan generator listrik frekuensi tinggi yang dinyalakan, diikuti dengan manajemen trauma.
Prosedur ini dilakukan dengan terlebih dahulu memasukkan jarum injeksi secara endoskopi ke dalam lapisan submukosa di tepi lesi dan menyuntikkan larutan injeksi, seperti metilen biru, ke dalamnya untuk mendorong pemisahan mukosa lesi dari lapisan submukosa.
Kemudian jarum suntik ditarik dan dimasukkan ke dalam perangkap, dan mukosa yang ditinggikan dari lesi serta mukosa normal di sekitarnya dimasukkan ke dalam perangkap, dan lesi di dalam perangkap dipotong dengan menyalakan generator listrik frekuensi tinggi.
Jika ada sedikit darah yang keluar dari luka, epinefrin dapat disemprotkan ke luka untuk menghentikan pendarahan; klip titanium juga dapat digunakan untuk menjepit luka untuk menghentikan pendarahan.